巨头蛇颈龟很容易生病，所以在饲养中，不仅要注意饲养方式，还要学习自己为其检查身体健康。巨头蛇颈龟人工繁殖比较困难，一般情况下繁殖成功的案例都是野外自然繁殖的。
一只健康蛇颈龟的重量应该是持续增长的，同时要具有鼓出并且明亮的眼睛，食欲好，排泄物坚实，龟的排泄物可以直接表现出它们是否健康。健康的龟在眼睛与鼻子上是不会出现多余的粘稠物的，舌头也不应该是白色的。
蛇颈龟很容易被多种寄生虫病传染，所以新购得的龟一定要先隔离观察一段时间再与其他的龟混养。箱龟的体重如果很轻，或者不是很健康，应该马上去联系兽医。不健康的龟应该放在室内饲养，将温度升高至29度。湿度也要相应增加。不可以让病龟冬眠。