緬甸孔雀龜的背甲上有着一快快的斑紋，看上去就像是孔雀尾巴上的羽毛，所以被稱爲孔雀龜，也有人稱她爲眼斑沼龜。緬甸孔雀龜的體型不大，屬於中等體型的水龜品種。
緬甸孔雀龜甲殼最長可生長至22釐米，雌性體型大於雄性。脊椎和肋骨的甲板上有眼狀的斑，淺棕色深褐色的斑點亦圍繞着盾甲生長。眼狀斑點可能會隨年齡增長而減退。底甲呈白色而淺橙黃色。緬甸孔雀龜頭部細小，嘴部不突出。面板顏色是棕色和綠色，白色的條紋從頭部伸延至頸部。幼龜甲板後部邊緣有些尖銳的鋸齒形，甲板邊緣會隨着年齡的增長而變得光滑。
緬甸孔雀龜背甲整體背甲底色爲淺綠色，背甲上面有明顯的黑斑很像孔雀尾巴上的斑紋，孔雀龜也是因此得名，背部高聳。四肢有力，但游泳水平一般，建議人工飼養時水位最好不要太深。雌龜體型較大，腹甲平坦，尾短，泄殖腔孔在背甲邊緣之內;雄龜體小，腹甲中央凹陷，尾長，泄殖腔孔在背甲邊緣之外。