虹吸式馬桶的優點是衝力強勁，沖水噪音較小；缺點是比較費水，沖水時易堵塞，手紙不能直接扔在馬桶中。其優缺點具體如下：
一、優點
1、衝力強勁
虹吸式馬桶的排水管道呈“s”型，在排水管道充滿水後會產生一定的水位差，借沖洗水在便器內的排污管內產生的吸力將污物排走，容易沖掉黏附在馬桶表面的污物，內部非常乾淨。
2、噪音小
虹吸式馬桶採用的是吸入式的排污方式，所以池內存水面較大，沖水噪音較小，也被稱爲靜音馬桶。
二、缺點
1、耗費水
虹吸式馬桶沖水時先要放水至很高的水面，然後纔將污物衝下去，所以要具備一定水量纔可達到衝淨的目的，每次至少要用8升至9升水，相對來說比較費水。
2、易堵塞
虹吸式馬桶的排水管徑爲56公分左右，沖水時容易堵塞，所以手紙不能直接扔在馬桶裏中，安裝虹吸式馬桶一般還要配備紙簍和搋子。