甘草應用廣泛，但近些年來也有不少報道論述其不可用的諸多方面。例如《陝西中醫雜誌》1987年第1期肖氏文章“國老亦有冷落時”，論述了不可應用甘草的5個方面，如病勢急而不宜緩者、氣機壅滯而正不虛者、有形實邪內阻者、作用部位不相宜、配伍禁忌等諸方面皆不可應用甘草。再如李氏在《中醫雜誌》1996年第9期一文述及：甘草可引起低血鉀症，並論述了甘草有效成分次酸致低血鉀症的5個機理：甘草次酸具有促腎上腺皮質激素的作用;甘草次酸能增強醛固酮的活性;甘草次酸抑制肝臟5α及5β甾類還原酶活性;甘草次酸與鹽皮質激素受體結合而發揮作用;⑤甘草次酸對Ⅱβ-羥基類固醇脫氫酶(Ⅱβ—OHSD)的抑制作用。雖然現代中藥學研究的有效成分作用不能等同於傳統的中藥功效，但還是要作爲參考。
總的來說，應用甘草須注意以下幾個方面。
1、十八反中有“藻戟遂芫俱戰草”之說，近代雖然有不少報導可以甘遂、甘草合用，大戟、甘草合用、芫花與甘草合用，但在具體應用時，還是謹慎爲好，尤其是甘草的劑量方面。有人報導在以上配伍中，大劑量應用會出現反作用，其量少則無反作用。
2、藥物配伍得當，療效顯著;配伍不當，則會降低療效出現不良後果。如酸甘化陰法中甘草和酸味藥的劑量比要恰當。
3、嘈雜吐酸明顯者，不宜用甘草。因甘草味甘甜，用之則助其胃酸增多而嘈雜吐酸更重，尤其是蜜炙甘草更不可用。
4、寒溼壅滯中焦而胃脘脹滿者不宜用。因甘草味甘性緩，會助溼邪難解，脹滿加劇，如用時必配伍溫散之品方可。《湯液本草》說：“甘者令人中滿，中滿者勿食甘。”
5、熱證實證需清熱時要用生甘草，虛寒證需補益時則用炙甘草。