1、不要超時加熱。食品放入微波爐解凍或加熱，若忘記取出，如果時間超過2小時，則應丟掉不要，以免引起食物中毒。微波爐的加熱時間要視材料及用量而定，還和食物新鮮程度、含水量有關。由於各種食物加熱時間不一，故在不能肯定食物所需加熱時間時，應以較短時間爲宜，加熱後可視食物的生熟程度再追加加熱時間。否則，如時間太長，會使食物變得發硬，失去香、色、味，甚至產生毒素。按照食物的種類和烹飪要求，調節定時及功率(溫度)旋鈕，可以仔細閱讀說明書，加以瞭解。
2、不要用普通塑料容器。一是熱的食物會使塑料容器變形，二是普通塑料會放出有毒物質，污染食物，危害人體健康。
3、不要用金屬器皿。因爲放入爐內的鐵、鋁、不鏽鋼、搪瓷等器皿，微波爐在加熱時會與之產生電火花並反射微波，既損傷爐體又不能加熱食物。 不要使用封閉容器：加熱液體時應使用廣口容器，因爲在封閉容器內食物加熱產生的熱量不容易散發，使容器內壓力過高，易引起爆破事故。
另外，我們也需要注意對微波爐的清潔，以讓它更加長壽。
1、每次用畢，用溼毛巾將爐的內壁及轉盤抹淨，再用乾毛巾抹去所有水分，並將爐門開啟片刻以通風散熱。抹乾淨門縫及門鉸，切勿遺留新物引致爐門不能開關而泄漏輻射。
2、爐壁四角、四周與爐門相接之處，應常保持清潔。如有清潔劑或食物碎屑及油漬殘留在門鉸及門縫上，可用溼布沾些中性潔劑擦去，切勿用磨潔布或粗糙帶腐蝕性的清潔劑去擦或用小刀去刮，致傷爐壁的金屬保護層。微波爐用過後若不隨即擦拭，很容易在內部結成油垢，所以只好用特別的招數除垢：放一杯水入爐，大火煮2至3分鐘，讓微波爐內充滿蒸氣，這樣可使頑垢因飽含水分而變得鬆軟，容易去除。
3、如爐內有異味，可置一杯水入爐內，加一湯匙檸檬汁或白醋，大火熱2至3分鐘，移去杯子再拭淨，異味便會消除。